Staphylococcus haemolyticus JCSC1435

The prediction was done using a set of srn genes identified from SRD curated sRNAs.

Numbers of SRD’S predicted srn sequences =

subject_seq_id	identity	length	mismatch	gapopen	query_start	query_end	subject_start	subject_end	evalue	bitscore
tmRNA	87.78	360	42	2	2133978	2134336	359	1	7e-116	420
4.5S	94.44	234	13	0	2548252	2548485	234	1	4e-98	361
srn_3960_sRNA323	98.37	184	3	0	1103503	1103686	184	1	6e-87	324
srn_3960_sRNA323	98.37	184	3	0	971566	971749	184	1	6e-87	324
srn_3960_sRNA323	98.37	184	3	0	880215	880398	184	1	6e-87	324
srn_3960_sRNA323	98.37	184	3	0	2499775	2499958	1	184	6e-87	324
srn_3960_sRNA323	98.37	184	3	0	2543463	2543646	1	184	6e-87	324
RNAseP	87.32	276	27	8	1492210	1492483	435	166	2e-82	309
srn_1480_sRNA130	81.82	330	58	2	2424739	2425067	609	281	2e-72	276
6S	89.81	216	18	4	1327397	1327610	218	5	6e-72	274
srn_0100_sRNA6	82.89	298	51	0	29482	29779	1	298	3e-70	268
srn_4830_Sau6072	87.56	225	26	2	527671	527894	240	17	2e-67	259
srn_2090_sRNA180	83.70	270	44	0	2050987	2051256	270	1	2e-66	255
srn_0230_rsaOX	95.42	153	6	1	32292	32443	1	153	2e-62	243
srn_0120_Teg6as	98.47	131	0	2	94677	94805	276	406	1e-58	230
srn_0120_Teg6as	100.00	120	0	0	30071	30190	287	406	2e-56	222
srn_0120_Teg6as	100.00	119	0	0	120084	120202	287	405	7e-56	220
srn_0120_Teg6as	98.35	121	2	0	100943	101063	406	286	1e-53	213
srn_0120_Teg6as	89.26	121	10	3	781029	781148	287	405	4e-34	148
srn_0120_Teg6as	86.89	122	13	3	2346426	2346546	287	406	1e-29	134
srn_2130_rsaE	86.45	214	21	6	2004446	2004655	216	7	4e-58	228
srn_9380_sRNA298	99.18	122	0	1	94682	94802	12	133	3e-55	219
srn_9380_sRNA298	98.35	121	0	2	120081	120200	14	133	5e-53	211
srn_9380_sRNA298	99.15	117	0	1	30071	30187	18	133	2e-52	209
srn_9380_sRNA298	97.50	120	2	1	100946	101065	133	15	8e-51	204
srn_9380_sRNA298	89.08	119	9	4	781029	781146	18	133	5e-33	145
srn_9380_sRNA298	86.55	119	12	4	2346426	2346543	18	133	5e-28	128
srn_3040_Sau50	93.15	146	10	0	1465231	1465376	148	3	3e-54	215
srn_3050_sRNA242	89.57	163	17	0	1461239	1461401	163	1	6e-52	207
srn_1640_rsaD	90.91	154	12	2	2282595	2282747	174	22	2e-51	206
srn_3550_Teg75	92.86	140	4	3	1147846	1147982	145	9	4e-49	198
srn_9030_sRNA54	98.23	113	1	1	1018570	1018681	117	5	1e-48	196
srn_9030_sRNA54	100.00	106	0	0	1653737	1653842	12	117	1e-48	196
srn_9030_sRNA54	100.00	105	0	0	2086932	2087036	117	13	5e-48	195
srn_9030_sRNA54	100.00	105	0	0	1090099	1090203	13	117	5e-48	195
srn_9030_sRNA54	100.00	105	0	0	1536016	1536120	13	117	5e-48	195
srn_9030_sRNA54	99.07	108	0	1	1658201	1658308	117	11	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	2589046	2589149	117	14	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	350265	350368	14	117	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	2304341	2304444	117	14	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	1013842	1013945	14	117	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	1101485	1101588	117	14	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	1950819	1950922	14	117	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	2585965	2586068	14	117	2e-47	193
srn_9030_sRNA54	100.00	104	0	0	2589562	2589665	14	117	2e-47	193
srn_9410_sRNA308	100.00	105	0	0	1090098	1090202	1	105	5e-48	195
srn_9410_sRNA308	100.00	105	0	0	1018571	1018675	105	1	5e-48	195
srn_9410_sRNA308	100.00	104	0	0	2086933	2087036	105	2	2e-47	193
srn_9410_sRNA308	100.00	104	0	0	1536016	1536119	2	105	2e-47	193
srn_9410_sRNA308	100.00	104	0	0	1653738	1653841	2	105	2e-47	193
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	2589047	2589149	105	3	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	350265	350367	3	105	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	2304342	2304444	105	3	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	1013842	1013944	3	105	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	1658202	1658304	105	3	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	1101486	1101588	105	3	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	1950819	1950921	3	105	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	2585965	2586067	3	105	6e-47	191
srn_9410_sRNA308	100.00	103	0	0	2589562	2589664	3	105	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	105	0	0	1950817	1950921	1	105	5e-48	195
srn_9290_sRNA236	100.00	105	0	0	2585963	2586067	1	105	5e-48	195
srn_9290_sRNA236	100.00	105	0	0	2589560	2589664	1	105	5e-48	195
srn_9290_sRNA236	100.00	104	0	0	350264	350367	2	105	2e-47	193
srn_9290_sRNA236	100.00	104	0	0	1658202	1658305	105	2	2e-47	193
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	2589047	2589149	105	3	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	2304342	2304444	105	3	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	2086933	2087035	105	3	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	1013842	1013944	3	105	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	1090100	1090202	3	105	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	1536017	1536119	3	105	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	1101486	1101588	105	3	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	1653739	1653841	3	105	6e-47	191
srn_9290_sRNA236	100.00	103	0	0	1018571	1018673	105	3	6e-47	191
srn_0860_RsaOB	86.86	175	20	3	2637438	2637611	386	214	2e-47	193
srn_1410_Teg77	88.54	157	8	7	2471232	2471386	149	1	4e-44	182
srn_9570_sRNA305	81.98	222	24	15	2623414	2623628	1	213	6e-42	174
srn_3510_Teg74	85.00	180	12	12	1160117	1160290	300	130	3e-40	169
srn_2140_sRNA184	80.18	227	43	2	2003114	2003339	229	4	3e-40	169
srn_1690_sRNA143	85.37	164	22	1	2256477	2256640	206	45	3e-40	169
srn_4390_rsaOG	92.92	113	2	5	765472	765584	107	1	2e-37	159
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	2589039	2589123	85	1	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	350291	350375	1	85	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	2304334	2304418	85	1	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	2086925	2087009	85	1	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1013868	1013952	1	85	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1658194	1658278	85	1	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1090126	1090210	1	85	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1536043	1536127	1	85	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1101478	1101562	85	1	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1653765	1653849	1	85	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1018563	1018647	85	1	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	1950845	1950929	1	85	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	2585991	2586075	1	85	6e-37	158
srn_9270_sRNA186	100.00	85	0	0	2589588	2589672	1	85	6e-37	158
srn_4160_Sau25	92.79	111	4	3	971073	971181	109	1	6e-37	158
srn_4160_Sau25	84.94	166	12	10	879671	879830	159	1	2e-36	156
srn_4160_Sau25	92.11	114	4	5	2500343	2500454	1	111	2e-36	156
srn_4160_Sau25	93.40	106	4	3	2544031	2544134	1	105	8e-36	154
srn_4160_Sau25	92.45	106	5	3	1103015	1103118	105	1	4e-34	148
srn_4010_sRNA327	91.38	116	8	2	914909	915023	192	78	6e-37	158
srn_3650_sRNA289	91.38	116	8	2	1122490	1122604	120	6	6e-37	158
srn_1850_sRNA157	80.18	227	32	11	2175025	2175246	233	15	6e-37	158
srn_9330_sRNA273	91.30	115	9	1	1941583	1941696	115	1	2e-36	156
srn_9330_sRNA273	91.67	108	8	1	2610526	2610632	115	8	4e-34	148
srn_1250_sRNA110	88.37	129	14	1	2512066	2512194	168	41	8e-36	154
srn_2030_Teg52	89.66	116	10	2	2100069	2100184	114	1	1e-33	147
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	2589048	2589120	73	1	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	350294	350366	1	73	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	2304343	2304415	73	1	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	2086934	2087006	73	1	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1013871	1013943	1	73	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1658203	1658275	73	1	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1090129	1090201	1	73	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1536046	1536118	1	73	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1101487	1101559	73	1	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1653768	1653840	1	73	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1018572	1018644	73	1	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	1950848	1950920	1	73	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	2585994	2586066	1	73	3e-30	135
srn_9280_sRNA228	100.00	73	0	0	2589591	2589663	1	73	3e-30	135
srn_0030_Teg35	80.10	201	23	11	11082	11270	31	226	1e-29	134
srn_4140_sRNA338	100.00	68	0	0	1106784	1106851	68	1	2e-27	126
srn_4140_sRNA338	100.00	68	0	0	974834	974901	68	1	2e-27	126
srn_4140_sRNA338	100.00	68	0	0	883382	883449	68	1	2e-27	126
srn_4140_sRNA338	100.00	68	0	0	2496703	2496770	1	68	2e-27	126
srn_4140_sRNA338	100.00	68	0	0	2540413	2540480	1	68	2e-27	126
srn_1390_sRNA123	89.00	100	11	0	2475397	2475496	240	141	6e-27	124
srn_3610_SprC	86.67	105	10	3	2117472	2117574	40	142	1e-23	113
srn_1420_Sau60	89.89	89	7	2	2469414	2469501	88	1	1e-23	113
srn_0870_Teg38as	91.46	82	7	0	2633979	2634060	82	1	1e-23	113
srn_1320_sRNA117	100.00	58	0	0	2541634	2541691	58	1	6e-22	108
srn_1320_sRNA117	100.00	58	0	0	2497924	2497981	58	1	6e-22	108
srn_1320_sRNA117	100.00	58	0	0	882171	882228	1	58	6e-22	108
srn_1320_sRNA117	100.00	58	0	0	973623	973680	1	58	6e-22	108
srn_1320_sRNA117	100.00	58	0	0	1105573	1105630	1	58	6e-22	108
srn_9470_sRNA322	100.00	55	0	0	1105580	1105634	55	1	3e-20	102
srn_9470_sRNA322	100.00	55	0	0	973630	973684	55	1	3e-20	102
srn_9470_sRNA322	100.00	55	0	0	882178	882232	55	1	3e-20	102
srn_9470_sRNA322	100.00	55	0	0	2497920	2497974	1	55	3e-20	102
srn_9470_sRNA322	100.00	55	0	0	2541630	2541684	1	55	3e-20	102
srn_9200_sRNA101	100.00	55	0	0	2541639	2541693	55	1	3e-20	102
srn_9200_sRNA101	100.00	55	0	0	2497929	2497983	55	1	3e-20	102
srn_9200_sRNA101	100.00	55	0	0	882169	882223	1	55	3e-20	102
srn_9200_sRNA101	100.00	55	0	0	973621	973675	1	55	3e-20	102
srn_9200_sRNA101	100.00	55	0	0	1105571	1105625	1	55	3e-20	102
srn_4150_sRNA339	100.00	55	0	0	1105578	1105632	55	1	3e-20	102
srn_4150_sRNA339	100.00	55	0	0	973628	973682	55	1	3e-20	102
srn_4150_sRNA339	100.00	55	0	0	882176	882230	55	1	3e-20	102
srn_4150_sRNA339	100.00	55	0	0	2497922	2497976	1	55	3e-20	102
srn_4150_sRNA339	100.00	55	0	0	2541632	2541686	1	55	3e-20	102
srn_3470_sRNA274	94.03	67	4	0	1194897	1194963	69	3	3e-20	102
srn_0240_Teg37	98.18	55	1	0	34757	34811	1	55	1e-18	97.1
srn_0930_Teg76	90.41	73	5	2	2598840	2598911	72	1	5e-18	95.3
srn_0890_sRNA71	85.87	92	10	1	2609646	2609737	90	2	5e-18	95.3
srn_9050_sRNA62	83.67	98	16	0	2634549	2634646	100	3	2e-17	93.5
srn_4240_Teg84	98.11	53	1	0	838606	838658	79	27	2e-17	93.5
srn_1460_sRNA128	100.00	47	0	0	2457421	2457467	47	1	8e-16	87.9
srn_0170_Teg9as	100.00	46	0	0	30148	30193	1	46	3e-15	86.1
srn_0170_Teg9as	100.00	46	0	0	94763	94808	1	46	3e-15	86.1
srn_0170_Teg9as	100.00	45	0	0	2346505	2346549	2	46	1e-14	84.2
srn_0170_Teg9as	97.78	45	1	0	781108	781152	2	46	5e-13	78.7
srn_4750_sRNA384	85.71	77	6	4	2623411	2623485	105	32	2e-12	76.8
srn_4760_RsaX23	93.88	49	2	1	2623411	2623459	48	1	2e-11	73.1
srn_3160_RsaOD	95.45	44	2	0	1384941	1384984	94	51	8e-11	71.3